Nevýhodou tohoto způsobu přenosu dat je nemožnost vyvolávání událostí v druhé aplikaci při změně obsahu souboru. To znamená, že pokud první aplikace zapíše do souboru, pak se o tom druhá aplikace nedozví. Změnu zjistí teprve až druhá aplikace soubor sama přečte nebo až ji první aplikace informuje jiným způsobem.
Další, ještě větší nevýhodou je nespolehlivost diskových operací v síti počítačů. Sdílení souborů na síti je pomalé a při výpadku vzdáleného počítače může neúspěšný přístup trvat neúměrně dlouho. Při síťových diskových operacích je proto dobré nejdřív zjistit přítomnost vzdáleného PC v síti, například pomocí metody Pm.NetTestPC.